Hajdú János 1952-ben született a Zala megyei Gelsén. Nős, felesége dr. Fehérvári Erzsébet, ügyvéd.
1970-ben érettségizett a Zalaegerszegi Általános Gépipari Technikumban, majd 11 hónapos katonai szolgálat után a Gödöllői Agrártudományi Egyetem Mezőgazdasági Gépészmérnöki Karának hallgatója lett. 1976-ban gépészmérnöki diplomát szerzett.
Fiatal diplomásként a Paksi Állami Gazdaság Gyapai Kerületében helyezkedett el. Itt gyakornok, gépműhelyvezető, majd gépesítési ágazatvezető beosztásban dolgozott.
Gyapa pusztán élt 1990-ig, munkahelyén mezőgazdasági gépek javításával, karbantartásával, üzemeltetésével, valamint mezőgazdasági épületek és berendezéseik fenntartásával foglalkozott. Munkáját (párton kívüliként) állami díjjal, a Munka Érdemrend bronz fokozatával ismerték el. Ez idő alatt szakmérnöki diplomát szerzett a gödöllői egyetemen gépjavítás és alkatrészgyártás szakon, majd abszolutóriumot gazdálkodás szakon.
1988-ban társaival megalakították az MDF Tolna Megyei Szervezetét, majd paksi barátaival 1989-ben a paksi szervezetet, melynek hosszú időn át az elnöke, egy időre az MDF Országos Választmányának is a tagja volt. 2006 áprilisában a pártvezetés - számára követhetetlen - döntései miatt MDF tagságát kilépéssel megszüntette.
1990-ben magánvállalkozást alapított, társával Nagydorogon benzinkutat épített, melyet jelenleg is az általa irányított gazdasági társaság üzemeltet. 1997-től 2004-ig egy másik vállalkozásnak is vezetője; üzlettársával egy külföldi ásványvíz és üdítőitalt gyártó cég importőre és nagykereskedelmi termékforgalmazója.
1990-ben, az első szabad önkormányzati választáson a paksi képviselő-testületbe jutott. A gazdasági bizottság vezetőjeként és a pénzügyi bizottság tagjaként részt vett a helyi pénzügyi, gazdasági jellegű önkormányzati szabályok kidolgozásában.
A paksi önkormányzat második ciklusában ellenzéki képviselő volt, az általa helytelenített városvezetési módszerek elleni tiltakozásként az utolsó évben lemondott tisztségéről.
1998-ban az 1-es számú választókörzetben nyert egyéni mandátumot. 2002-ig ismét a képviselő-testület gazdasági bizottságát vezette. Ebben az időben meghatározó szerepet vállalt az erőmű és a város megromlott kapcsolatának helyreállításában.
2002-ben, Paks városában polgármesterré választották, és ismét az 1-es körzet képviselőjének. 2004-től a 14 Paks környéki települést tömörítő Paksi Többcélú Kistérségi Társulás elnöke.
2006-tól a Tolna Megyei Fejlesztési Tanács tagja, valamint a Tolna Megyei Kistérségi Fórum elnöke.
2009-től a Dél - Dunántúli Regionális Fejlesztési Tanács, valamint a Tervezési Bizottság tagja.
Négy évvel ezelőtt a választók bizalmából ismét elnyerte a polgármesteri címet.
2010-től a Paks és Környéke Hulladékgazdálkodási Társulás elnöke.
2010. szembertétől a Paksi Atomerőmű Zrt. felügyelő bizottságának tagjává választották.
Legfontosabb eredményének azt tartja, hogy az általa vezetett képviselő-testületek a közpénzekkel tisztán és hatékonyan gazdálkodtak, a város köznyugalmát politikai értelemben biztosítani tudta, a település arculata előnyösen változott.